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在义体高度普及的「新横滨」，记忆侦探森川零受雇调查一桩义体义肢失窃案，却追查出这些义体中埋藏着能够操控人类记忆的「幽灵芯片」。随着调查深入，他发现自己引以为傲的义体手臂，正是阴谋的一部分。

底层数据清道夫「回声」无意间截获了一段能瘫痪整座城市网络中枢的「湮灭代码」，随即成为各大财阀与地下黑客组织追杀的目标。他必须在七十二小时内，把代码交给唯一能破解它的旧日搭档。

文明崩溃二十年后的废土上，独行佣兵「孤狼」接下护送一位神秘少女穿越辐射区的任务。少女手中握有一把能重启全球能源网的「黎明之钥」，而各大幸存者势力都想将它据为己有。